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RNA 변형 데이터베이스
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RNA 변형 데이터베이스(RNA Motification Database)는 RNA 변형에 사용되는 데이터베이스와 웹 포털 및 서버의 모음이다. RNA 변형은 모든 살아있는 유기체에서 발생하며 RNA의 가장 진화적으로 보존된 특성 중 하나이다. 모든 살아있는 유기체에서 100가지 이상의 서로 다른 유형의 RNA 변형이 특성화되었다. 이는 RNA의 활성, 국소화 및 안정성에 영향을 줄 수 있으며 인간의 암 및 질병과 관련이 있다.
RNA 변형 데이터베이스
이름 | 설명 | 유형 | 링크 | 참고 문헌 |
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RMBase | RMBase는 고처리량 시퀀싱 데이터(Pseudo-seq, Ψ-seq, CeU-seq, Aza-IP, MeRIP-seq, m6A-seq, miCLIP, m6A-CLIP, RiboMeth-seq)의 Decoding을 위해 디자인되었다. 이는 전령 RNA, 조절 ncRNA (예: lncRNA, miRNA), 마이크로 RNA 표적 부위, RNA 결합 단백질(RBP) 결합 부위 및 질병 관련 SNP 내에 위치한 수천 개의 RNA 변형을 입증했다. | 데이터 베이스 | 웹사이트 | |
MODOMICS | MODOMICS는 변형된 리보뉴클레오사이드의 화학 구조, 생합성 경로, RNA 변형 효소 및 RNA 서열에서 변형된 잔기의 위치에 관한 포괄적인 정보를 제공하는 RNA 변형 데이터베이스다. | 데이터 베이스 | 웹사이트 | |
RNAMDB Archived 2012년 7월 22일 - 웨이백 머신 | RNAMDB는 자연적으로 발생하는 RNA 변형과 관련된 정보 의 초점 역할을 했다. | 데이터 베이스 | 웹사이트 Archived 2012년 7월 22일 - 웨이백 머신 | |
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